西红柿(Solanum lycopersicum)潜在内源性致敏蛋白的生物信息学筛选与分析
黄静贾瑞宗朱方超徐林郭运玲郭安平1
2017
发表期刊分子植物育种
期号08
摘要食物过敏是由于接触特定过敏原引起的异常免疫反应。西红柿营养价值丰富并且可作为天然抗氧化剂,已被人们熟识并广泛食用的蔬菜。为了对西红柿中的内源性致敏蛋白有全面的认识和了解,本工作利用全序列比对的方法比较了西红柿蛋白与已知致敏原之间的序列相似性,获得了西红柿潜在致敏蛋白序列,并分析及描述了它们的保守结构域、分子作用功能、系统发育情况以及在染色体的位置。结果表明:共鉴定120个西红柿内源性致敏蛋白,其中包括9个已被数据库收录的西红柿致敏原;保守结构域分析显示它们分别属于43个蛋白家族,主要分布于Gelsolin、Chloroa_b-bind和Thaumatin等家族,其中的HATPase_c结构域未在已知致敏蛋白中发现;Chloroa_b-bind和Thaumatin家族蛋白在绿色植物较特有,将这2个家族蛋白进行系统发育分析则分别揭示了西红柿的遗传多样性;而且预测的致敏蛋白在西红柿染色体上有成簇状分布的趋势。
关键词西红柿 致敏蛋白 生物信息学 交叉反应性
文献类型期刊论文
条目标识符http://ir.idsse.ac.cn/handle/183446/5234
专题深海科学研究部_深海生物学研究室_深海生物蛋白质组学及分子生物学研究组
作者单位1.中国热带农业科学院热带生物技术研究所
2.海南医学院基础医学与生命科学学院
3.中国科学院深海科学与工程研究所
4.中国热带农业科学院环境与植物保护研究所
推荐引用方式
GB/T 7714
黄静贾瑞宗朱方超徐林郭运玲郭安平. 西红柿(Solanum lycopersicum)潜在内源性致敏蛋白的生物信息学筛选与分析[J]. 分子植物育种,2017(08).
APA 黄静贾瑞宗朱方超徐林郭运玲郭安平.(2017).西红柿(Solanum lycopersicum)潜在内源性致敏蛋白的生物信息学筛选与分析.分子植物育种(08).
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